Life Technologies成立大中华区新一代测序数据解决方案中心

来自 : 发布时间：2024-05-14

Life Technologies所属爱普拜斯应用生物系统公司（Applied Biosystems）于2010年11月3日宣布在北京设立其大中华区新一代测序数据解决方案中心。借助生物信息技术的深化应用，该中心旨在帮助使用SOLiDTM基因测序系统的客户在系统运行之后建立数据分析方案，从而更加有效地利用研究数据结果。   SOLiD 系统是Life Technologies创新研发的一套基于连接法原理的高通量基因测序仪。自2007年上市以来，它已经升级了多次，从最初的SOLiD到SOLiD 3、SOLiD 4，再到目前最新的5500xl SOLiD 系统，通量翻了数倍。目前每次运行的通量最高达300 Gb，每天的通量都高达30 Gb。30 Gb，相当于人类基因组的10倍覆盖度！这意味着“人类基因组计划”多年的多国联合工作现在一天就可以完成了。   SOLiD系统以其无以匹敌的高精准度、可扩展的平台、自动化的工作流程、便于应用的工具包、整体性的数据分析方案以及多方位的后台支持为科学家们提供了一个功能强大的平台。   世界各国的研究人员纷纷使用SOLiD对癌症、糖尿病、神经障碍等疑难病症患者的基因特性进行研究，并以此推进个性化医疗的发展和普及。基因序列的获取将为人类的遗传疾病以及癌症等疾病的致病机理提供有利依据，并为接下来的分子诊断、基因治疗等个性化医疗提供必要前提条件，最终帮助人们达到有的放矢进行疾病的预防和治疗的目的。今后，个性化医疗方案将逐步替代千人用一药的传统医学治疗方案。更重要的是，通过基因治疗，不但可预防当事人日后发生疾病，还可预防其后代发生同样的疾病。   SOLiD助力肿瘤病例中染色体变异的检测约翰霍普金斯大学凯莫癌症研究中心和Life Technologies合作研究证明，新一代测序技术可以检测出乳腺癌及直肠癌等固态肿瘤病例中染色体的变异情况，这可能会对研究人员日后在研发控制病情发展和肿瘤对治疗反应的诊疗产品提供有效的帮助。他们的研究成果发表在《Science Translational Medicine》杂志上。   SOLiD发现癌症中的基因突变   Wellcome Trust Sanger Institute和爱普拜斯应用生物系统公司还在《Nature》杂志上联名发表了一篇论文，他们用SOLiD新一代测序技术识别了一条小细胞肺癌细胞株中的基因突变，同时还确认了该变异与吸烟之间的关系。该研究证明了新一代测序技术可以为对癌症中基因变异过程、细胞修复路径以及基因网络的研究提供崭新而富有意义的视角。   SOLiD揭开摇滚巨星基因中隐藏的秘密   Ozzy Osbourne是美国摇滚巨星黑暗王子，著名乐队black sabbath（黑色安息日）的灵魂人物。他的生活混乱程度和他的歌艺一样惊人，多次严重酗酒，也曾吸食过毒品。然而，他的健康状况到目前为止却没有出现大的问题。为此，Life Technologies公司用SOLiD 4测序仪对Osbourne的基因组进行了测序。经过数据分析，Osbourne基因中隐藏的秘密最终公之于众。测序结果表明：他的ADH4基因的“调控区域”发生了很少见的变异，这种变异可以代谢掉身体中的酒精。   海量数据如何分析   随着SOLiD测序通量的不断提高，研究人员在基因测序的过程中积累了大量的数据。一天30 Gb，一个月就达到Tb数量级。如今，可以说基因组测序不是难题，真正的挑战在于如何在短时间里处理这扑面而来的海量数据，从中提取出有用的信息？数据分析已经成为新一代测序技术的瓶颈！ABI新一代测序数据解决方案中心的成立，将进一步强化SOLiD原有的数分析能力，帮助研究人员更深入更系统地分析以获取理想的分析结果。   “该中心的建立是Life Technologies以客户为中心这一理念的具体体现。”Life Technologies亚太区总裁司马德利先生说，“我们希望该中心不仅能够帮助客户跨越在数据分析方面的瓶颈，更重要的是能增进我们与客户的密切合作，联手推进基因测序、基因分析和个性化医疗等领域的发展，从而为攻克像癌症这些对人类生命构成重大威胁的疾病做出我们的贡献。”   “如今在中国，无论在作物育种还是药品研发领域，都有越来越多的科研人员在应用基因测序技术进行研究。”Life Technologies 大中华地区总裁何国威先生说。“新建成的中心提供的数据分析服务将在客户的研究实验中起到非常重要的作用。”   研发能力是这个中心不可分割的一部分。该中心的科学家正在紧锣密鼓地就前沿性的生物信息学课题进行研究，例如全新基因组混合拼接法数据分析流程，该技术能够帮助SOLiD客户组合之前未知的基因。中心将借助爱普拜斯应用生物系统公司全球研发心的力量，竭尽全力为亚太地区的SOLiD用户提供世界一流的生物信息学方面的支持、培训与解决方案。   在试运营阶段，该中心将指导客户进行SOLiD首次运行数据分析，并系统化地为客户提供数据分析培训，为硬件设备与人员配备提供咨询和建议。从2011年起，数据分析中心将进一步强化数据分析培训服务，并在合作项目中为客户提供更强大的支持。该心在起始阶段专注于服务大中华区的客户，未来会将服务延伸到整个亚太地区。